请问二代测序的拼接用SOAP,velvet,abyss和Pharp,Cap3有什么差别吗?

请问二代测序的拼接用SOAP,velvet,abyss和Pharp,Cap3有什么差别吗?
谢谢大侠们,不知道这几款组装软件用起来是否有差别?
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赞同来自: gelement

因为二代测序的reads长度比较短,数据量比较大,所以都是基于De bruijn graph来进行组装的。Pharp和Cap3主要是针对长度比较长的reads。

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