GO注释,pathway分析

是否用blast2go,去做一批转录组基因的功能注释。如果是已经blast完成了的呢,而且结果是txt格式,导入blast2go要xml格式,转了半天不知能不能用,而且序列有17000多条,用笔记本跑blast2go会不会很慢呢?还可以用什么方法?谢谢!
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agonyr - QQ群 424014618

赞同来自: cerostar

需要重新做blast 用m7结果输出

huangshunmou - 挖掘生命奥秘

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-m 7 输出的结果就是xml格式的。

maoge001 - 90后育种男

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转录组无参考基因组的具体分析流程,各位可以发一下吗?我是新手。

luck_cc

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本人也想学习下无参考基因组的转录组分析方法,求教!

Hadron74

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转录组无参考序列可以考虑tophat+cufflinks的分析流程.

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