如果一个allel不符合HWE,那可能有什么原因?

请问有搞进化的么,如果一个allel不符合HWE,那可能有什么原因?

这是实际的genotype频率
[1] "NAA is 0.387362637362637 NAa is 0.107142857142857 Naa is 0.505494505494505"
这是expect的genotype频率
[1] "expect NAA is 0.194422850501147 expect NAa is 0.493022430865837 expect Naa is 0.312554718633015"

****SNP info:****
SNP (rs16891982)

Variation in SLC45A2 is associated with light skin color and is common only in populations of European ancestry.

有可能是population structure导致的吧?

我的数据来自1000 genome,现在计算出来的genotype是所有population的:
ASW CEU CHB CHS CLM FIN GBR IBS JPT LWK MXL PUR TSI YRI


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jmagicking_jyc

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我感觉没有的,很正常,全基因组群体数据里,有很多这样的数据

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