亲缘关系与进化树的关系

我认为物种的关系按照远近可以分为几个方面:
1、不同物种
2、同种物种,但是,不同的亚种
3、同种物种,同种品种(比如中国人),更近一步:一个家族
 
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我在看文献时:发现亲缘关系与进化树,在使用时,经常在一起。比如:《不同花色牡丹品种亲缘关系的rapd-pcr分析》。
那么,可以理解为:通过进化树结果,分析得到亲缘关系。
而一个家族中的血缘关系(kinship)是最近的关系
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现在,对于全球随机采样的样品,是否可以通过进化树来分析血缘关系。
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yhu0309 - 生物信息学菜鸟

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很想回答这个问题,我只是说说我的想法,不一定正确,不正确的地方请大家批评指正。
首先楼主的提问非常好,想把亲缘关系和进化树的关系对应起来,从而对其亲缘关系进行鉴定。
对于构建进化树,不同的物种,不同的对象有不同的方法。如果是针对不同物种,我们一般用18s或者ITS序列进行构建即可。如果是同种物种的不同亚种可以通过直系同源的差异来确定。如果是针对同一物种的不同家族,那么就需要更加可靠的证据来判断,例如SNP标记、甲基化CpG岛分布,甚至是基因频率来构建进化树(Phylip软件包有基因频率的方法来构建进化树)。如果楼主对这些方法感兴趣,大可以试一试。

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