论文中,用不同数据库(nr,swissprot等)进行注释,然后比较分析,怎么理解和应用呢?

本人做了个转录组测序工作,有专家给出建议:注释时,如果可能,建议把不同的数据库如,nr,swissprot等分别注释,这样更为清晰。对于这句话我不太了解,有经验的朋友给篇文章或者直接给做个说明吧,初涉此领域,还请讲的通俗一些哦^_^。
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不同的库,侧重点稍微有区别。比如有的侧重功能,有的侧重通路,这样混起来看的话,很乱的~

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