下载基因注释信息时如何获得SNP ID及对应的reference ID?

下载基因注释信息时如何获得SNP ID及对应的reference ID?我要下载一些需要的注释信息,物种是猪,从ensembl中基本上把所有注释信息下载下来了,可是没有看到我需要的相对应信息,60K芯片结果SNP的ID是ALGA0000087种类型的,在ensembl中输入ALGA0000087能找到对应的reference ID:rs81348458,
但是我从ensembl中下载基因注释信息只能下载到reference ID,没有相应的SNP ID,请问如何获得SNP ID,且与reference ID相对应的文件?或者只能对应position才能对应这两者?
已邀请:

bioclown

赞同来自: michelia

Enseml中有一个很不错的工具,BioMart,可以定制你自己需要的下载,仔细研究下吧

bioclown

赞同来自:

2013-01-14_154932.jpg


这是我用BioMart搜的结果,看是不是你需要的格式,还可以做更多的定制

要回复问题请先登录注册